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通过生物信息网站设计课题

时间:2017-11-14 11:42:14 浏览:

没有课题?几个生物信息网站来帮你

  来源 郁金香 实验万事屋

不少人有这样的困惑:来实验室一两年了,还没找到一个可行的课题,面对毫无作为的现实,我们常常怀疑自己,我是不是不适合做科研,不然怎么荒废了两年还找不到课题,其实不然,只是因为你还没找到合适的方法,随着大数据时代的到来,充分的运用生物信息学知识会让你做到事半功倍,下面我就介绍几个常用的网站来给你解说,该如何找课题。

 

众所周知,磷酸化广泛存在于各种蛋白中,对蛋白功能的调控具有非常的意义,我今天着重介绍蛋白磷酸化课题的寻找。

 

首先找到一个你感兴趣的蛋白,我以GRB2为例,找到GRB2可能会发生磷酸化的位点,进入网站:

 

 

搜索后,选GRB2

 

 

我们发现,GRB2有很多可能发生磷酸化的位点,选择一个被预测次数最多(最有可能)的位点,Y209位最有可能,被预测208

因此我们就以GRB2 Y209位磷酸化作为一个起点,去寻找可能使之发生磷酸化的激酶。

 

进入网站


搜索后,找到Y209,点击其后的Kinase Pred

 

这样我们就可以找到使之发生磷酸化的激酶,最有可能的是SYK

 

为了进一步验证其可能性,我们需要探究SYKGRB2之间是否有相互作用,可以进入网站,http://www.string-db.org

 

 

搜索后,继续选定GRB2

 

点击继续

 

 

点击继续

 

 

获得搜索结果后,我们可以看到SYKGRB2之间被预测有相互作用,这就表明SYK可能与GRB2相互作用,随后使之Y209位磷酸化。

 

通过文献查找,我们发现,竟然真有文章报道了

 

这就表明,用这种方法是可以找到一些非常好的课题。有了这些大数据网站的帮忙,你还再也不用自己找不到课题了。
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