PubMed 文献使用方法

怎样挖掘PubMed的文献？

来源右哉实验万事屋

普通的PubMed大家当然会用，但实际应用中，这些方法也只是一点点小技巧。对于文章的探索，其实是文本挖掘。就举个简单的例子：

这是一款简单的文本挖掘的工具，用它可以实现基础的文本挖掘，也就是两个词之间，多个词之间或者两组词之间的文献关联性。

说简单点，就是从文章里挖出已知的两个关键词的关系。比如我们搜最简单的，肺癌和P53之间的关联：

这个工具能告诉你两者相互关联的文献有多少，然后列出具体文献目录和链接。当然，我们可以更直观点，通过多词关联分析看看关系图：

我们会看到这样的关联图：

两者有关联的证据数量是30，这个都是比较确切的证据。那我们多设置几个基因一起分析呢？就变成了这样的网络图：

是不是没太看懂？没关系，这个是有图例的：

比如箭头代表的就是关联性，不同颜色代表抑制或者促进的关系，菱形的空白节点代表仅在摘要中有共存。当然，我们也可以调整图片，在下面的下拉菜单里直接看文献中能挖掘出来的基因互作：

结果就变成了这样：

当然，每个作为证据的节点，都是可以点击的PubMed的超链接，也就是从图上，直接再返回到文献中：