快速找出miRNA相关的信号通路

如何快速找出miRNA相关的信号通路？

原创右哉实验万事屋

那天突然有人问我，miRNA是不是能做出那种network的网络图，就跟那种文章里一样？

其实我自己也忘了到底应该怎么整了，简单点的话，就自己去搜搜看miRNA怎么样对应基因做成列表就行了吧。但是负责任的我，还是搜到了一些miRNA分析的工具。

对，就是上面这个工具，可以分析单个基因或者多个基因对单个miRNA和多个miRNA，实际上跟形成network图没什么关系。只是觉得这个网址做出来的东西，还蛮有意思的。我们可以搜多个miRNA与多个基因间的关系：

然后，它就会生成这么一个特别草率的二型网络图……

点击里面的miRNA这边的方块，就能显示miRNA分别对于各个靶基因的关系：

嗯，边上还有一个kegg的图标，这个是给你做好的这些靶基因位于哪些信号通路的结果，点一下就会显示：

有这个基因所在的信号通路的位置，包含了它能结合的miRNA结合位点……可以直观地看看miRNA到底作用在什么信号套路上。

当然，对于基因，也有相应的描述，比如，这个基因到底有多少个剪接异构本：

分别是哪些剪接异构本能结合你搜的这个miRNA：

可能你也没考虑过不同的剪接异构本，受到的miRNA的调控不一样吧……